1、公司清算，50万需要补缴即可；

2、注册资本现在不用验资程序，存进即可，不会冻结；

3、日常运营只能用实缴资本，注册资本只是个注册金额，不是实际的数。

没有债务问题是可以正常的注销的，你没债务问题，就不存在损害债权人利益，破产清算之所以要追缴未实缴的注册资本，是因为企业有负债，没有偿还，所以追缴未实缴的注册资本。
这就相当于股东欠公司钱，公司欠别人钱，现在公司没钱了，就要追股东的责任，对认缴但未实缴的部分追偿。但是如果你没有债务问题，就没有这个问题。

如果没有债权人追究的话，认缴的注册资本无需补缴。

但是如果有债权人且债权人起诉追究的话，需要在未实缴注册资本范围内承担责任，甚至是连带责任。在此种情况下，存入账户后也不会被冻结，取决于公司账户是否被冻结。

公司日常运营应当使用实缴注册资本，否则资金压力过大，到头来还要承担股东责任，得不偿失。

多说一句，在公司运营时应根据实际情况以支付投资款的名义把注册资本直接支付至公司账户，一来履行了出资义务，二来公司日常运作本来就需要资金。所以，规范化才是保护股东最好的方法。